
BioEmu是由微软研究院开发的生成式深度学习系统,旨在高效模拟蛋白质的动态结构及平衡态构象。通过整合大量蛋白质结构数据、分子动力学模拟数据和实验蛋白质稳定性数据,BioEmu能够精确预测蛋白质的平衡态构象,相对能误差控制在1 kcal/mol以内。
BioEmu的主要功能包括高效生成蛋白质结构样本、模拟蛋白质动态变化、预测蛋白质热力学特性、提供实验可验证的假设、支持个性化医疗以及降低计算成本。该系统基于生成式深度学习架构,拥有定性和定量的模拟能力,能够同时模拟蛋白质结构和热力学性质。BioEmu的应用场景包括科学研究、药物开发、医疗应用和补充传统方法。
BioEmu的计算要求较低,可以在普通的深度学习硬件上高效运行,适合大多数科研机构的计算环境。用户需要具备一定的生物学和计算机科学基础,特别是对蛋白质结构和机器学习有基本理解会有助于更好地使用该系统。BioEmu还可以与其他软件结合使用提高工作效率。
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