前Meta工程师推出AI生物模型ESM3,模拟5亿年生物进化历程

9个月前发布AI俱乐部
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前Meta工程师推出AI生物模型ESM3,模拟5亿年生物进化历程的封面图

据报道,Meta 通过与 EvolutionaryScale 的合作,开发出了一种名为 ESM3 的新型蛋白质语言模型,它代表了对现有蛋白质预测和设计工具的重大升级。

此项创新有望加速生物研究的进程。例如,该模型能够预测一种特定蛋白质的组成部分,即氨基酸,并生成一个能够有效发光的全新绿色荧光蛋白 (esmGFP),从而显著提升了当前蛋白质设计流程的速度和效率。

EvolutionaryScale 是一家由 Nat Friedman、Daniel Gross 以及 Lux Capital 等投资者支持的初创公司,已成功融资超过 1.42 亿美元。ESM3 代表了第三代模型,其卓越的性能已通过内部和外部的基准测试得到证实,并且 EvolutionaryScale 计划通过其 API 提供该模型的使用权限。

那么,EvolutionaryScale 在蛋白质领域究竟有何作为?他们的目标是利用蛋白质语言模型来学习和模拟自然界中蛋白质的进化规律,从而能够更准确地预测和设计蛋白质的功能和结构。为了实现这一目标,他们需要分析大量的蛋白质序列数据,包括 RNA、蛋白质结构以及 DNA,以便建立一个能够理解生物分子之间复杂关系的深度学习模型。凭借这种模型,科学家们可以更有效地发现和设计具有特定功能的蛋白质,例如用于药物开发、生物材料和工业酶等领域。

为了验证该方法的有效性,研究人员进行了一系列实验。例如,他们尝试利用该模型来优化 GFP 的性能,结果发现,在经过优化后的 B8 变体中,GFP 的亮度提高了 50%,同时其表达水平降低了 43%。 此外,在另一项实验中,ESM3 成功地将 C10 变体的溶解度提高到了与野生型 GFP 相似的水平。

值得注意的是,包括 Google Deepmind 和 Isomorphic Labs 在内的其他公司也在积极探索蛋白质领域,但 EvolutionaryScale 采取了一种独特的策略。展望 2023 年,预计将涌现出更多基于蛋白质语言模型的研究成果,而 ESM3 有望在推动蛋白质科学发展方面发挥关键作用,从而加速创新。

关键要点:

💡 据报道,Meta 与 EvolutionaryScale 合作推出了 ESM3,这是一款用于蛋白质预测和设计的先进语言模型。

💡 ESM3 能够通过预测蛋白质的氨基酸序列来设计全新的绿色荧光蛋白,从而在短短 5 轮迭代中实现传统方法难以企及的优化效果,极大地促进了蛋白质工程领域的进步。

💡 ESM3 的卓越性能已通过内外部评估得到验证,并且 EvolutionaryScale 计划通过 API 提供该模型的使用权限,从而进一步推动蛋白质科学的发展。

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